Thiết kế được xác thực của Dell cho lĩnh vực chăm sóc sức khỏe và khoa học đời sống với Dell PowerEdge C6520 và XE8545 (3)

Clara Parabricks là bộ phần mềm tăng tốc để thực hiện phân tích thứ cấp dữ liệu NGS. Bộ phần mềm này cung cấp quyền truy cập vào hơn 50 công cụ tăng tốc GPU, bao gồm ánh xạ, căn chỉnh và xử lý hậu kỳ, cùng với nhiều phương thức gọi biến thể hỗ trợ các ứng dụng dòng mầm, soma và RNA. Người dùng có thể xây dựng các đường ống phân tích thứ cấp được thiết kế theo nhu cầu của họ để mang lại kết quả ở tốc độ nhanh và chi phí thấp. Clara Parabricks phân tích toàn bộ bộ gen người gấp 50 lần trong khoảng 60 phút trên máy chủ bốn GPU, so với khoảng 24 giờ khi sử dụng phần cứng CPU truyền thống.

Bộ phần mềm Clara Parabricks chạy trên nhiều loại GPU máy chủ có sẵn tại chỗ hoặc trên đám mây. Nó chia tỷ lệ tuyến tính với số lượng tài nguyên GPU. Clara Parabricks tạo ra kết quả nhất quán trên các GPU khác nhau và tạo ra kết quả giống nhau với mỗi lần thực thi. Các kết quả tương đương với quy trình Các phương pháp hay nhất của GATK. Phiên bản hiện tại của Clara Parabricks hỗ trợ tất cả các phiên bản GATK cho đến v4.2 cùng với DeepVariant v1.1. Ngoài ra, có năm người gọi soma, hai người gọi biến thể cấu trúc và hai người gọi hợp nhất gen. Với các công cụ do NVIDIA tạo ra, người dùng có thể dễ dàng hợp nhất nhiều VCF, chú thích và lọc dựa trên mức độ phù hợp của BAM. Hơn nữa, các quy trình phân tích của Clara Parabricks có thể dễ dàng tùy chỉnh và các bước mới có thể được thêm vào một cách dễ dàng. Clara Parabricks v4.0.0-1 đã được sử dụng cho kiến ​​trúc này.