Máy chủ cơ sở hạ tầng
Máy chủ cơ sở hạ tầng được sử dụng để quản trị hệ thống và cung cấp quyền truy cập cho người dùng. Chúng thường không liên quan đến tính toán, nhưng chúng cung cấp các dịch vụ quan trọng đối với toàn bộ hệ thống HPC. Các máy chủ này được sử dụng làm nút quản lý và nút đăng nhập. Đối với các cụm có kích thước nhỏ, một máy chủ vật lý duy nhất có thể cung cấp các chức năng quản lý hệ thống cần thiết. Các máy chủ cơ sở hạ tầng cũng có thể được sử dụng để cung cấp các dịch vụ lưu trữ bằng cách sử dụng NFS, trong trường hợp đó chúng phải được cấu hình với các ổ đĩa bổ sung hoặc một mảng lưu trữ bên ngoài. Một máy chủ quản lý là bắt buộc đối với hệ thống HPC để triển khai và quản lý hệ thống. Nếu cần có chức năng quản lý tính sẵn sàng cao (HA), thì cần có hai máy chủ quản lý. Các nút đăng nhập là tùy chọn. Dell Technologies khuyến nghị và một máy chủ đăng nhập cho mỗi 30 đến 100 người dùng.
Cấu hình cơ sở được khuyến nghị cho các máy chủ cơ sở hạ tầng là:
- Máy chủ Dell PowerEdge R650
- Bộ xử lý kép Intel Xeon Silver 4314
- 256 GB RAM (DIMM 16 x 16 GB 3200 Megatransfers mỗi giây (MTps))
- Bộ điều khiển ĐỘT KÍCH PERC H345
- Hai RAID 1 SSD SATA Sử dụng Hỗn hợp 480GB
- Doanh nghiệp Dell iDRAC
- Hai bộ nguồn 750 W (PSU)
- NVIDIA ® ConnectX-6 InfiniBand TM HCA (tùy chọn)
Cấu hình cơ sở đề xuất cho máy chủ cơ sở hạ tầng được mô tả như sau:
Máy chủ PowerEdge R650 phù hợp với vai trò này. Các cụm HPC điển hình sẽ chỉ sử dụng một vài máy chủ cơ sở hạ tầng; do đó, mật độ không phải là một ưu tiên, nhưng khả năng quản lý là quan trọng. Bộ xử lý Intel Xeon Silver 4314, với 16 lõi trên mỗi ổ cắm, là đề xuất cơ bản cho vai trò này. Nếu máy chủ cơ sở hạ tầng được sử dụng cho các tác vụ sử dụng nhiều CPU, chẳng hạn như biên dịch phần mềm hoặc xử lý dữ liệu, thì bộ xử lý có khả năng cao hơn có thể phù hợp. 256 GB RAM được cung cấp bởi mười sáu DIMM 16 GB cung cấp đủ dung lượng bộ nhớ với chi phí tối thiểu trên mỗi GB, đồng thời cung cấp băng thông bộ nhớ tốt. Những máy chủ này dự kiến sẽ không thực hiện nhiều I/O, do đó, SSD SATA sử dụng hỗn hợp được định cấu hình với RAID 1 phải đủ cho hệ điều hành. Đối với các hệ thống nhỏ (bốn nút trở xuống), mạng Ethernet có thể cung cấp đủ hiệu suất ứng dụng. Đối với hầu hết các hệ thống khác, HDR InfiniBand có thể là kết nối dữ liệu được lựa chọn. Nó cung cấp kết cấu thông lượng cao, độ trễ thấp cho giao tiếp giữa các nút hoặc để truy cập các giải pháp Lưu trữ Thiết kế được Dell xác thực.
Máy chủ tính toán
Máy chủ điện toán cung cấp tài nguyên điện toán cho hệ thống HPC. Cấu hình tốt nhất cho máy chủ điện toán phụ thuộc vào các ứng dụng cụ thể đang được sử dụng và các yêu cầu về thời gian quay vòng.
Do cấu hình tốt nhất có thể khác nhau đối với từng trường hợp sử dụng, Dell Technologies cung cấp một bảng các tùy chọn được đề xuất phù hợp với các máy chủ này. Có thể chọn một cấu hình cụ thể để phù hợp với yêu cầu của khối lượng công việc và trường hợp sử dụng. Các tiêu chí liên quan cần xem xét trước khi chọn cấu hình máy chủ điện toán được thảo luận trong phần hiệu suất ứng dụng của sách trắng này. Các tùy chọn cấu hình đề xuất cho máy chủ điện toán được cung cấp trong Bảng 1.
chức năng máy |
Sự miêu tả |
nền tảng |
Nền tảng CPU với CPU Intel: Dell PowerEdge C6520 (bốn máy chủ trong 2U) Nền tảng GPU với CPU AMD: Dell PowerEdge XE8545 (4U) Dell PowerEdge R7525 (2U) 2U, hai CPU cộng với GPU/FPGA/cấu hình thẻ đầy đủ Cấu hình Riser 3, chiều dài đầy đủ V2, khe cắm 5×16 |
bộ vi xử lý |
Hai Intel Xeon Gold 8358 (32 lõi mỗi ổ cắm) Hai AMD EPYC™ 7543 thế hệ thứ ba (32 lõi trên mỗi ổ cắm) |
Tùy chọn bộ nhớ |
512 GB (DIMM 16 x 32 GB 3200 MTps) |
Tùy chọn GPU |
Bốn NVIDIA A100-SXM4-40 GB hoặc -80 GB (XE8545) Hai NVIDIA A100-80 GB (R7525 với quạt hiệu suất cao) |
Tùy chọn lưu trữ |
Bộ điều khiển ĐỘT KÍCH PERC H755 Bốn Tập đoàn Intel 3,2 TB Dell Ent NVMe P5600 MU U.2 3,2 TB trong RAID 0 (XE8545) |
iDRAC |
DRAC Express (C6520) iDRAC Doanh nghiệp (XE8545 và R7525) |
nguồn điện |
Hai PSU 2400 W (C6400) Bốn PSU 2400 W (XE8545) Hai PSU 2400 W (R7525) |
mạng |
Bộ điều hợp NVIDIA ® ConnectX®-6 HDR100 InfiniBand™ |
Kho
-
Dell cung cấp một loạt các mục đích chung và giải pháp lưu trữ HPC. Để biết tổng quan chung về danh mục giải pháp HPC của Dell, hãy truy cập www.gtekvn.com . Thông thường có ba tầng lưu trữ cho HPC: lưu trữ sơ bộ, lưu trữ hoạt động và lưu trữ lưu trữ, khác nhau về kích thước, hiệu suất và độ bền.
Đối với những khách hàng muốn có một hệ thống tệp song song hiệu suất cao được chia sẻ, giải pháp Lưu trữ BeeGFS được Dell xác thực được hiển thị trong Hình 1là phù hợp. Giải pháp này có thể mở rộng quy mô lên tới nhiều petabyte dung lượng lưu trữ.
Lưu trữ đầu có xu hướng tồn tại trong toàn bộ thời gian của một lần phân tích dữ liệu. Nó có thể được sử dụng để chứa dữ liệu tạm thời không thể nằm trong bộ nhớ chính của hệ thống điện toán do không đủ dung lượng bộ nhớ vật lý. Các ứng dụng HPC có thể được coi là “I/O bị ràng buộc” nếu quyền truy cập vào bộ lưu trữ cản trở tiến trình phân tích dữ liệu. Đối với các khối lượng công việc HPC này, giải pháp tiết kiệm chi phí nhất thường là cung cấp đủ bộ nhớ cục bộ được gắn trực tiếp trên các nút điện toán. Đối với các tình huống mà ứng dụng yêu cầu hệ thống tệp dùng chung trên toàn cụm máy tính, thì hệ thống tệp dùng chung hiệu suất cao sẽ phù hợp hơn là dựa vào bộ lưu trữ được gắn trực tiếp cục bộ. Nhìn thấyHình 2. Thông thường, việc sử dụng bộ lưu trữ cục bộ được gắn trực tiếp mang lại hiệu suất và giá tổng thể tốt nhất và được coi là phương pháp hay nhất cho hầu hết các phân tích dữ liệu NGS. Vì lý do này, các cấu hình được đề xuất bao gồm bộ lưu trữ cục bộ với hiệu suất và dung lượng phù hợp cho nhiều khối lượng công việc sản xuất. Nếu các yêu cầu về khối lượng công việc dự kiến vượt quá hiệu suất và dung lượng được cung cấp bởi các cấu hình lưu trữ cục bộ được đề xuất, thì cần lưu ý đến kích thước lưu trữ đầu một cách thích hợp dựa trên khối lượng công việc.
Đối với nghiên cứu này, giải pháp BeeGFS dung lượng cao được sử dụng cho các thư mục gia đình và cơ quan trong khi các máy chủ giải pháp BeeGFS hiệu suất cao làm bộ lưu trữ đầu.
Bài viết mới cập nhật
AI trong Khoa học sự sống: Một cách tiếp cận thực tế với máy tính cá nhân
Máy tính Dell AI lý tưởng cho các tổ chức khoa ...
Dập tắt các mối đe dọa cấp BIOS bằng bảo mật được hỗ trợ bởi phần cứng
Tìm hiểu cách dữ liệu từ xa của thiết bị Dell ...
Thiết kế Edge cho tương lai
Dịch vụ Edge của Dell và nền tảng NativeEdge cải tiến ...
Máy tính lỗi thời là lỗ hổng trong lớp giáp an ninh mạng của bạn
Hiện đại hóa đội tàu của bạn để duy trì khả ...